El acceso al pabellón se realiza a través de un sugerente "bosque/lluvia" simbólico, compuesto por cañas de bambú que cuelgan del techo y que actúan como espacio de separación y retiro del bullicio exterior de la Expo.

El recorrido se inicia por un corredor de límites ambiguos que irradian una agradable luz tenue y ligeramente azulada generando un ambiente amable y una sensación de bienestar.
Se trata de un espacio indefinido, delimitado por unas paredes blancas y curvadas que, junto con unos efectos luminosos, crean en el visitante la sensación de estar inmerso en una atmósfera acuosa. En esta etapa, diversos textos breves y apelativos evocan el poder del agua para dar y regenerar vida. 
Por un lado, sobre las paredes se proyectan en seis idiomas (español, inglés, francés, alemán, italiano y árabe) tres binomios de palabras: Dios-agua, Cristo-manantial, Iglesia-fuente.

Por otro lado, antes de llegar a la siguiente etapa, se encuentra una producción audiovisual de unos 4 minutos, dividida conceptualmente en cuatro apartados: “agua y vida”, “agua que destruye”, “agua que regenera” y “agua, signo de lo sagrado”. Diversos textos breves y apelativos acompañan evocando el poder del agua para dar y regenerar vida.

Esta etapa ocupa la parte central del pabellón. Recorriendo su interior se realiza una mirada histórica y bíblica del líquido elemento a través 39 obras de arte de gran significación cristiana e importante valor artístico. Doce de estas piezas proceden los Museos Vaticanos, una de la basílica de San Pedro del Vaticano, veinte de distintas diócesis aragonesas y otras 6 de diversas colecciones privadas y museos españoles.

Las piezas, que abarcan desde el siglo IV (arte paleocristiano) al siglo XX, aparecen distribuidas temáticamente. El visitante encuentra primero algunas referidas al Antiguo Testamento y después, al Bautismo de Cristo, a sus milagros y enseñanzas y a la Pasión. También hay obras relacionadas con la Liturgia. 

Último espacio del recorrido, en él se hace referencia a la dimensión ética de la gestión del agua y a los valores religiosos asociados a ella. Esta etapa invita a pensar sobre la necesidad de utilizar este recurso de manera solidaria para afrontar la crisis del agua con la que el hombre ha comenzado el siglo XXI.

El final del recorrido conduce a un pequeño espacio circular, la Capilla del Santísimo. Concebido como un lugar de oración y recogimiento, es un espacio bello y luminoso donde el ambiente invita a reflexionar sobre lo visto y orar ante el Santísimo en compañía de una imagen de la Virgen del Mar.